MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 42332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018690	TTG	2	6	176	181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691595
2	NC_018690	TCG	2	6	215	220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691595
3	NC_018690	CGG	2	6	284	289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691595
4	NC_018690	AGA	2	6	333	338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
5	NC_018690	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691595
6	NC_018690	CGG	2	6	495	500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691595
7	NC_018690	TTA	2	6	523	528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691595
8	NC_018690	CGGT	2	8	533	540	0 %	25 %	50 %	25 %	407691595
9	NC_018690	TGA	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691595
10	NC_018690	TAA	2	6	705	710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691595
11	NC_018690	AAG	2	6	722	727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
12	NC_018690	ATT	2	6	750	755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691595
13	NC_018690	TAA	2	6	762	767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691595
14	NC_018690	ATT	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691595
15	NC_018690	GAA	2	6	817	822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
16	NC_018690	G	6	6	845	850	0 %	0 %	100 %	0 %	407691595
17	NC_018690	ACC	2	6	867	872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691595
18	NC_018690	TGA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691595
19	NC_018690	A	6	6	904	909	100 %	0 %	0 %	0 %	407691595
20	NC_018690	GAA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
21	NC_018690	GAA	2	6	937	942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
22	NC_018690	CTT	2	6	1085	1090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691595
23	NC_018690	A	6	6	1121	1126	100 %	0 %	0 %	0 %	407691595
24	NC_018690	ACA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691595
25	NC_018690	CTCGTC	2	12	1193	1204	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407691595
26	NC_018690	AAG	2	6	1346	1351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
27	NC_018690	ACA	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691596
28	NC_018690	AGC	2	6	1466	1471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691596
29	NC_018690	TAA	2	6	1492	1497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691596
30	NC_018690	A	6	6	1622	1627	100 %	0 %	0 %	0 %	407691596
31	NC_018690	AGC	2	6	1661	1666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691596
32	NC_018690	GAA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691596
33	NC_018690	GTTA	2	8	1696	1703	25 %	50 %	25 %	0 %	407691596
34	NC_018690	TGAT	2	8	1818	1825	25 %	50 %	25 %	0 %	407691596
35	NC_018690	ACGG	2	8	1919	1926	25 %	0 %	50 %	25 %	407691596
36	NC_018690	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691596
37	NC_018690	AGTG	2	8	2029	2036	25 %	25 %	50 %	0 %	407691596
38	NC_018690	GGTGT	2	10	2090	2099	0 %	40 %	60 %	0 %	407691596
39	NC_018690	TGCG	2	8	2208	2215	0 %	25 %	50 %	25 %	407691596
40	NC_018690	GCGT	2	8	2244	2251	0 %	25 %	50 %	25 %	407691596
41	NC_018690	AAG	3	9	2301	2309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691596
42	NC_018690	TGG	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691596
43	NC_018690	GCT	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691596
44	NC_018690	TTA	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691596
45	NC_018690	ATC	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691597
46	NC_018690	AAT	2	6	2590	2595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691597
47	NC_018690	TC	3	6	2611	2616	0 %	50 %	0 %	50 %	407691597
48	NC_018690	AATTTT	2	12	2635	2646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691597
49	NC_018690	CTG	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691597
50	NC_018690	T	6	6	2693	2698	0 %	100 %	0 %	0 %	407691597
51	NC_018690	CGGT	2	8	2709	2716	0 %	25 %	50 %	25 %	407691597
52	NC_018690	TGA	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691597
53	NC_018690	GGTC	2	8	2807	2814	0 %	25 %	50 %	25 %	407691597
54	NC_018690	A	6	6	2824	2829	100 %	0 %	0 %	0 %	407691597
55	NC_018690	TAA	2	6	2871	2876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691597
56	NC_018690	TTA	2	6	2935	2940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691597
57	NC_018690	TGG	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691597
58	NC_018690	CCA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691597
59	NC_018690	TGCG	2	8	3137	3144	0 %	25 %	50 %	25 %	407691597
60	NC_018690	TG	3	6	3398	3403	0 %	50 %	50 %	0 %	407691597
61	NC_018690	TGAT	2	8	3464	3471	25 %	50 %	25 %	0 %	407691597
62	NC_018690	CAA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691597
63	NC_018690	ACC	3	9	3745	3753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691598
64	NC_018690	TGC	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691598
65	NC_018690	AATG	2	8	3806	3813	50 %	25 %	25 %	0 %	407691598
66	NC_018690	GTG	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691598
67	NC_018690	GTT	2	6	3859	3864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691598
68	NC_018690	GTT	2	6	3939	3944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691598
69	NC_018690	CCG	2	6	3968	3973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691598
70	NC_018690	CTA	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691598
71	NC_018690	TCTTTT	2	12	4001	4012	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407691598
72	NC_018690	TAC	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691598
73	NC_018690	TGG	2	6	4205	4210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691598
74	NC_018690	GCA	3	9	4220	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691598
75	NC_018690	AAT	2	6	4244	4249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691598
76	NC_018690	AG	3	6	4255	4260	50 %	0 %	50 %	0 %	407691598
77	NC_018690	T	7	7	4564	4570	0 %	100 %	0 %	0 %	407691599
78	NC_018690	GAA	2	6	4650	4655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691599
79	NC_018690	TGC	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691599
80	NC_018690	TTA	2	6	4822	4827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691599
81	NC_018690	TTG	2	6	4858	4863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691599
82	NC_018690	CGG	2	6	4901	4906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691599
83	NC_018690	TAG	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691599
84	NC_018690	A	6	6	4976	4981	100 %	0 %	0 %	0 %	407691599
85	NC_018690	AGA	2	6	5015	5020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691599
86	NC_018690	TCA	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691599
87	NC_018690	ATT	2	6	5165	5170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691599
88	NC_018690	AGA	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691599
89	NC_018690	TG	3	6	5265	5270	0 %	50 %	50 %	0 %	407691599
90	NC_018690	A	6	6	5319	5324	100 %	0 %	0 %	0 %	407691599
91	NC_018690	ATT	2	6	5352	5357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691599
92	NC_018690	GCG	2	6	5358	5363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691599
93	NC_018690	ACT	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691599
94	NC_018690	ATT	2	6	5522	5527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691599
95	NC_018690	CGT	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691599
96	NC_018690	AAT	2	6	5575	5580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691599
97	NC_018690	CAA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691600
98	NC_018690	TGT	2	6	5736	5741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691600
99	NC_018690	ATTT	2	8	5753	5760	25 %	75 %	0 %	0 %	407691600
100	NC_018690	AGT	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691600
101	NC_018690	CCA	2	6	5870	5875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691600
102	NC_018690	TTTC	2	8	5887	5894	0 %	75 %	0 %	25 %	407691600
103	NC_018690	CATA	2	8	5942	5949	50 %	25 %	0 %	25 %	407691600
104	NC_018690	TCA	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691600
105	NC_018690	GAT	2	6	5978	5983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691600
106	NC_018690	CTT	2	6	5999	6004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691600
107	NC_018690	ACG	2	6	6048	6053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691600
108	NC_018690	ACCG	2	8	6099	6106	25 %	0 %	25 %	50 %	407691600
109	NC_018690	TCA	2	6	6196	6201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691600
110	NC_018690	TTATAA	2	12	6205	6216	50 %	50 %	0 %	0 %	407691600
111	NC_018690	ACTGA	2	10	6338	6347	40 %	20 %	20 %	20 %	407691600
112	NC_018690	ACG	2	6	6348	6353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691600
113	NC_018690	TAA	2	6	6366	6371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691600
114	NC_018690	GTTT	2	8	6406	6413	0 %	75 %	25 %	0 %	407691600
115	NC_018690	TGA	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691600
116	NC_018690	CAC	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691600
117	NC_018690	GTT	2	6	6599	6604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691600
118	NC_018690	TTTA	2	8	6648	6655	25 %	75 %	0 %	0 %	407691600
119	NC_018690	AAT	2	6	6769	6774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691600
120	NC_018690	T	7	7	6830	6836	0 %	100 %	0 %	0 %	407691600
121	NC_018690	ATG	2	6	6988	6993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691601
122	NC_018690	AAG	2	6	6998	7003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691601
123	NC_018690	CGT	2	6	7219	7224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691601
124	NC_018690	TTTAA	2	10	7291	7300	40 %	60 %	0 %	0 %	407691601
125	NC_018690	GAA	2	6	7306	7311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691601
126	NC_018690	GTTA	2	8	7680	7687	25 %	50 %	25 %	0 %	407691601
127	NC_018690	GAT	2	6	7779	7784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691601
128	NC_018690	CTTG	2	8	7800	7807	0 %	50 %	25 %	25 %	407691601
129	NC_018690	GCG	2	6	7819	7824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691601
130	NC_018690	TGT	2	6	7835	7840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691601
131	NC_018690	CTGG	2	8	7887	7894	0 %	25 %	50 %	25 %	407691601
132	NC_018690	AT	3	6	7917	7922	50 %	50 %	0 %	0 %	407691601
133	NC_018690	AATT	2	8	7964	7971	50 %	50 %	0 %	0 %	407691601
134	NC_018690	ATT	2	6	8015	8020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691601
135	NC_018690	GAT	2	6	8026	8031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691601
136	NC_018690	A	6	6	8041	8046	100 %	0 %	0 %	0 %	407691601
137	NC_018690	AAC	2	6	8063	8068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691601
138	NC_018690	GGC	2	6	8115	8120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691601
139	NC_018690	GGT	2	6	8127	8132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691601
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265	NC_018690	AATT	2	8	14590	14597	50 %	50 %	0 %	0 %	407691608
266	NC_018690	AAC	2	6	14616	14621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691608
267	NC_018690	GTA	2	6	14744	14749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691608
268	NC_018690	CATTCA	2	12	14757	14768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691608
269	NC_018690	GCT	2	6	14772	14777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691608
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294	NC_018690	GCATAT	2	12	16554	16565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407691610
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392	NC_018690	TGCT	2	8	21561	21568	0 %	50 %	25 %	25 %	407691617
393	NC_018690	TGT	2	6	21626	21631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691617
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396	NC_018690	TG	3	6	21761	21766	0 %	50 %	50 %	0 %	407691617
397	NC_018690	CCATT	2	10	21772	21781	20 %	40 %	0 %	40 %	407691617
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468	NC_018690	TAA	2	6	24808	24813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691620
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